โรงเรียนสามัญศึกษา หลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 กระทรวงศึกษาธิการ เปิดสอน 2 หลักสูตร ดังนี้

        1. หลักสูตรปกติ
        โรงเรียนภัทราวดี หัวหินใช้หลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 ฉบับปรับปรุงแก้ไข 2566 กระทรวงศึกษาธิการ เปิดสอน 8 กลุ่มสาระการเรียนรู้ ได้แก่
        1) กลุ่มสาระการเรียนรู้ภาษาไทย
        2) กลุ่มสาระการเรียนรู้คณิตศาสตร์
        3) กลุ่มสาระการเรียนรู้วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
        4) กลุ่มสาระการเรียนรู้สังคมศึกษา ศาสนาและวัฒนธรรม
        5) กลุ่มสาระการเรียนรู้สุขศึกษาและพลศึกษา
        6) กลุ่มสาระการเรียนรู้ศิลปะ
        7) กลุ่มสาระการเรียนรู้การงานอาชีพ
        8) กลุ่มสาระการเรียนรู้ภาษาต่างประเทศ

        2. โครงการห้องเรียนพิเศษภาษาอังกฤษ (English Program) แบบทดลอง
ในปีการศึกษา 2568 โรงเรียนภัทราวดี หัวหิน แผนกมัธยมศึกษา จะเปิดโครงการ

ห้องเรียนพิเศษภาษาอังกฤษ (English Program) แบบทดลอง โดยจัดการเรียนการสอนตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 หรือหลักสูตรสถานศึกษา โดยจะจัดการเรียนการสอนเป็นภาษาอังกฤษในรายวิชาต่าง ๆ ทั้ง 8 กลุ่มสาระการเรียนรู้ (ยกเว้นวิชาภาษาไทยที่จัดการเรียนการสอนเป็นภาษาไทย แต่ใช้หลักสูตรภาษาไทยสำหรับผู้พูดภาษาไทยเป็นภาษาต่างประเทศ (Thai Language for Non-Native))

        นอกจากรายวิชาใน 8 กลุ่มสาระการเรียนรู้ทั้งในหลักสูตรปกติและโครงการห้องเรียนพิเศษภาษาอังกฤษแบบทดลองแล้ว ทางโรงเรียนยังได้สอนวิชาเสริมพิเศษต่าง ๆ ให้แก่นักเรียนทุกคน อาทิ ย้อมคราม ดนตรีไทย นาฏศิลป์ไทย-สากล การปั้นเซรามิก วรรณคดีและการแสดง การสร้างสรรค์สื่อดิจิทัล ปัญญาประดิษฐ์ (AI) การแนะแนวอาชีพ เป็นต้น โดยเชิญวิทยากรพิเศษจากหลากหลายสาขาเพื่อให้ความรู้แก่นักเรียนอย่างต่อเนื่อง เพื่อเป็นการเสริมสร้างประสบการณ์ใหม่ อีกทั้งเป็นแนวทางให้นักเรียนสามารถนำความรู้ต่างๆ ไปบูรณาการและต่อยอดต่อไปได้ในอนาคต